====== การใช้งาน CRI wiki สำหรับนักวิจัย ======
===== การพิมพ์สูตรคณิตศาสตร์ =====
เราสามารถแสดงสูตรคณิตศาสตร์ ดังตัวอย่างข้างล่างนี้ได้
delim{lbrace}{matrix{3}{1}{{3x-5y+z=0} {sqrt{2}x-7y+8z=0} {x-8y+9z=0}}}{ }
delim{|}{{1/N} sum{n=1}{N}{gamma(u_n)} - 1/{2 pi} int{0}{2 pi}{gamma(t) dt}}{|} <= epsilon/3
จะแสดงผลดังนี้
delim{lbrace}{matrix{3}{1}{{3x-5y+z=0} {sqrt{2}x-7y+8z=0} {x-8y+9z=0}}}{ }
delim{|}{{1/N} sum{n=1}{N}{gamma(u_n)} - 1/{2 pi} int{0}{2 pi}{gamma(t) dt}}{|} <= epsilon/3
** วิธีใช้ **
math formula
tag ที่ใช้คือ %%%% \\
size คือขนาด font ถ้าไม่ใส่จะใช้ font ขนาด 12 \\
math formula คือสูตรคณิตศาสตร์ที่ต้องการแสดงผล
สรุปการแสดงสัญลักษณ์ต่างๆ
^ เครื่องหมายทางคณิตศาสตร์ ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| x+y | x+y |
| x-y | x-y |
| x*y | x*y |
| x/y | x/y |
| x^y | %%x^y%% |
| x_y | x_y |
| x=y | x=y |
| x<>y | x<>y |
| x>y | x>y |
| x>=y | x>=y |
| x | xx<=y | %%x<=y%% |
| |x| | %%|x|%% |
| sin(x) | sin(x) |
| vec{x} | vec{x} |
| overline{x} | overline{x} |
| underline{x} | underline{x} |
| hat{x} | hat{x} |
^ สํญลักษณ์ ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| infty | infty |
| in | in |
| notin | notin |
| forall | forall |
| exists | exists |
| notexists | notexists |
| partial | partial |
| approx | approx |
| pm | pm |
| inter | inter |
| union | union |
| ortho | ortho |
| parallel | parallel |
| backslash | backslash |
| prime | prime |
| wedge | wedge |
| vert | vert |
| lbrace | lbrace |
| rbrace | rbrace |
| circ | circ |
| varnothing | varnothing |
| subset | subset |
| notsubset | notsubset |
| cdots | cdots |
| vdots | vdots |
| ddots | ddots |
^ ลูกศร ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| left | left |
| right | right |
| leftright | leftright |
| doubleleft | doubleleft |
| doubleright | doubleright |
| nearrow | nearrow |
| searrow | searrow |
^ Matrix ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| matrix{2}{3}{a b c d e f} | matrix{2}{3}{a b c d e f} |
^ ตาราง ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| tabular{111}{1111}{a b c d e f g} | tabular{111}{1111}{a b c d e f g} |
| tabular{1001}{101}{1 2 3 4 5 6} | tabular{1001}{101}{1 2 3 4 5 6} |
^ อื่นๆ ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| {express}under{foo} | {express}under{foo} |
| {express}over{foo} | {express}over{foo} |
^ อักษรกรีก ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| alpha | alpha |
| beta | beta |
| gamma | gamma |
| delta | delta |
| epsilon | epsilon |
| varepsilon | varepsilon |
| zeta | zeta |
| eta | eta |
| theta | theta |
| vartheta | vartheta |
| iota | iota |
| kappa | kappa |
| lambda | lambda |
| mu | mu |
| nu | nu |
| xi | xi |
| pi | pi |
| varpi | varpi |
| rho | rho |
| varrho | varrho |
| sigma | sigma |
| varsigma | varsigma |
| tau | tau |
| upsilon | upsilon |
| phi | phi |
| varphi | varphi |
| chi | chi |
| psi | psi |
| omega | omega |
| Gamma | Gamma |
| Lambda | Lambda |
| Sigma | Sigma |
| Psi | Psi |
| Delta | Delta |
| Xi | Xi |
| Upsilon | Upsilon |
| Omega | Omega |
| Theta | Theta |
| Pi | Pi |
| Phi | Phi |
^ เซต ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| bbR | bbR |
| bbN | bbN |
| bbZ | bbZ |
| bbC | bbC |
^ รูท ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| sqrt{a} | sqrt{a} |
| root{n}{a} | root{n}{a} |
^ ลิมิต ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| int{a}{b}{x} | int{a}{b}{x} |
| doubleint{a}{b}{x} | doubleint{a}{b}{x} |
| tripleint{a}{b}{x} | tripleint{a}{b}{x} |
| oint{a}{b}{x} | oint{a}{b}{x} |
| sum{a}{b}{x} | sum{a}{b}{x} |
| prod{a}{b}{x} | prod{a}{b}{x} |
| bigcup{a}{b}{x} | bigcup{a}{b}{x} |
| bigcap{a}{b}{x} | bigcap{a}{b}{x} |
^ วงเล็บ ^ คำสั่งที่ใช้ ^
| delim{[}{x}{]} | delim{[}{x}{]} |
| delim{lbrace}{x}{rbrace} | delim{lbrace}{x}{rbrace} |
| delim{|}{x}{|} | %%delim{|}{x}{|}%% |
| delim{vert}{x}{vert} | delim{vert}{x}{vert} |
===== การพิมพ์สูตรเคมี =====
ตัวอย่างการพิมพ์สูตรเคมี
C2H6
Na2HPO4 12H2O
C2H5O2|-Na+ เครื่องหมาย | เป็นตัวแยกคำ
Cl2H6N2Pt2+
Al2(SO4)3
ผลลัพธ์
C2H6 \\
Na2HPO4 12H2O \\
C2H5O2|-Na+ \\
Cl2H6N2Pt2+ \\
Al2(SO4)3
** วิธีใช้ **
สูตรเคมี
===== การอ้างอิง journal ใน PubMed =====
สามารถเขียนการอ้างอิง journal ใน PubMed ได้ด้วย PMID ดังนี้
การแสดงผลแบบสั้น ให้พิมพ์
{{pubmed>short:15100837}}
จะแสดงผลดังนี้
{{pubmed>short:15100837}}
การแสดงผลแบบยาว ให้พิมพ์
{{pubmed>long:15100837}}
จะแสดงผลดังนี้
{{pubmed>long:15100837}}
===== การอ้างอิง protein family ของ InterPro =====
InterPro เป็นฐานข้อมูล protein families ที่จัดการโดย EMBL-EBI
วิธีการอ้างอิง protein family โดยใช้ InterPro ID ทำได้ดังนี้
{{interpro>link:IPR001466}}
ผลลัพธ์จะเป็นดังนี้
{{interpro>link:IPR001466}}
===== การใช้งาน Jmol =====
ต้องทำการติดตั้ง Java ที่เว็บ บราวเซอร์ ก่อน จึงจะสามารถใช้งาน Jmol ได้
Jmol เป็นตัวแสดงโครงสร้างเคมีของโปรตีนด้วย Java applet ดังตัวอย่างข้างล่างนี้
{{:manual:researchers:jmol_option.png|}}
** วิธีใช้ **
===== การอ้างอิง RCSB protein data bank (PDB) =====
สามารถเข้าถึง RCSB protein data bank และ NCBI structure database ได้ด้วย PDB ID
แสดงภาพขนาดเล็ก จาก RCSB protein data bank ให้พิมพ์
{{pdb>small:1WLA}}
จะได้ผลลัพธ์ดังนี้
{{pdb>small:1WLA}}
แสดงภาพขนาดกลาง จาก RCSB protein data bank ให้พิมพ์
{{pdb>medium:1WLA}}
จะได้ผลลัพธ์ดังนี้
{{pdb>medium:1WLA}}
แสดงภาพขนาดใหญ่ จาก RCSB protein data bank ให้พิมพ์
{{pdb>large:1WLA}}
จะได้ผลลัพธ์ดังนี้
{{pdb>large:1WLA}}
แสดงเฉพาะลิงก์ สำหรับ PDB ID ให้พิมพ์
{{pdb>link:1WLA}}
จะได้ผลลัพธ์ดังนี้
{{pdb>link:1WLA}}
แสดงลิงก์ และคำอธิบายอย่างย่อจาก NCBI structure database ให้พิมพ์
{{pdb>short:1WLA}}
จะได้ผลลัพธ์ดังนี้
{{pdb>short:1WLA}}
แสดงลิงก์ และคำอธิบายอย่างละเอียดจาก NCBI structure database ให้พิมพ์
{{pdb>long:1WLA}}
จะได้ผลลัพธ์ดังนี้
{{pdb>long:1WLA}}
แสดง searchbox สำหรับ RCSB PDB ให้พิมพ์
{{pdb>searchbox}}
จะได้ผลลัพธ์ดังนี้
{{pdb>searchbox}}
การแปลงค่าจาก PDB ID ให้เป็น structureID ของ NCBI ให้พิมพ์
{{pdb>structureID:1WLA}}
จะได้ผลลัพธ์ดังนี้
{{pdb>structureID:1WLA}}
แสดงภาพขนาดเล็ก และคำอธิบายอย่างละเอียด ให้พิมพ์
{{pdb>fullSmall:1WLA}}
จะได้ผลลัพธ์ดังนี้
{{pdb>fullSmall:1WLA}}
===== การอ้างอิงโครงสร้างเคมีใน PubChem =====
สามารถสร้างลิงก์ หรือโครงสร้างเคมี จาก PubChem ได้ด้วย CID (Compound ID)
แสดงเฉพาะลิงก์ ไปยังโครงสร้างเคมี ให้พิมพ์
{{pubchem>link:6248}}
จะแสดงผลดังนี้
{{pubchem>link:6248}}
แสดงภาพโครงสร้างเคมี ขนาดเล็ก ให้พิมพ์
{{pubchem>small:6248}}
จะแสดงผลดังนี้
{{pubchem>small:6248}}
แสดงภาพโครงสร้างเคมี ขนาดใหญ่ ให้พิมพ์
{{pubchem>large:6248}}
จะแสดงผลดังนี้
{{pubchem>large:6248}}
แสดง searchbox ของ PubChem ให้พิมพ์
{{pubchem>searchbox}}
จะแสดงผลดังนี้
{{pubchem>searchbox}}
แสดงสูตรเคมีของสารประกอบ ให้พิมพ์
{{pubchem>formula:6248}}
จะแสดงผลดังนี้
{{pubchem>formula:6248}}
แสดงชื่อ IUPAC ให้พิมพ์
{{pubchem>IUPAC:6248}}
จะแสดงผลดังนี้
{{pubchem>IUPAC:6248}}
===== การอ้างอิง UniProt database =====
Uniprot เป็น protein database ที่จัดการโดย EMBL-EBI
แสดงลิงก์ด้วยชื่อโปรตีน ให้พิมพ์
{{uniprot>name:LACTB_HUMAN}}
จะแสดงผลดังนี้
{{uniprot>name:LACTB_HUMAN}}
แสดงลิงก์ด้วย protein accession ID ให้พิมพ์
{{uniprot>pac:P83111}}
จะแสดงผลดังนี้
{{uniprot>pac:P83111}}