การใช้งาน CRI wiki สำหรับนักวิจัย

เราสามารถแสดงสูตรคณิตศาสตร์ ดังตัวอย่างข้างล่างนี้ได้

  <m>delim{lbrace}{matrix{3}{1}{{3x-5y+z=0} {sqrt{2}x-7y+8z=0} {x-8y+9z=0}}}{ }</m>

  <m 16>delim{|}{{1/N} sum{n=1}{N}{gamma(u_n)} - 1/{2 pi} int{0}{2 pi}{gamma(t) dt}}{|} <= epsilon/3</m>

จะแสดงผลดังนี้

วิธีใช้

  <m size>math formula</m>

tag ที่ใช้คือ <m>
size คือขนาด font ถ้าไม่ใส่จะใช้ font ขนาด 12
math formula คือสูตรคณิตศาสตร์ที่ต้องการแสดงผล

สรุปการแสดงสัญลักษณ์ต่างๆ

เครื่องหมายทางคณิตศาสตร์ คำสั่งที่ใช้ x+y x-y x*y x/y x^y x_y x=y x<>y x>y x>=y x<y x<=y |x| sin(x) vec{x} overline{x} underline{x} hat{x} สํญลักษณ์ คำสั่งที่ใช้ infty in notin forall exists notexists partial approx pm inter union ortho parallel backslash prime wedge vert lbrace rbrace circ varnothing subset notsubset cdots vdots ddots ลูกศร คำสั่งที่ใช้ left right leftright doubleleft doubleright nearrow searrow Matrix คำสั่งที่ใช้ matrix{2}{3}{a b c d e f} ตาราง คำสั่งที่ใช้ tabular{111}{1111}{a b c d e f g} tabular{1001}{101}{1 2 3 4 5 6} อื่นๆ คำสั่งที่ใช้ {express}under{foo} {express}over{foo}

อักษรกรีก คำสั่งที่ใช้ alpha beta gamma delta epsilon varepsilon zeta eta theta vartheta iota kappa lambda mu nu xi pi varpi rho varrho sigma varsigma tau upsilon phi varphi chi psi omega Gamma Lambda Sigma Psi Delta Xi Upsilon Omega Theta Pi Phi เซต คำสั่งที่ใช้ bbR bbN bbZ bbC รูท คำสั่งที่ใช้ sqrt{a} root{n}{a} ลิมิต คำสั่งที่ใช้ int{a}{b}{x} doubleint{a}{b}{x} tripleint{a}{b}{x} oint{a}{b}{x} sum{a}{b}{x} prod{a}{b}{x} bigcup{a}{b}{x} bigcap{a}{b}{x} วงเล็บ คำสั่งที่ใช้ delim{[}{x}{]} delim{lbrace}{x}{rbrace} delim{|}{x}{|} delim{vert}{x}{vert}

ตัวอย่างการพิมพ์สูตรเคมี

  <chem>C2H6</chem>
  <chem>Na2HPO4 12H2O</chem>
  <chem>C2H5O2|-Na+</chem> เครื่องหมาย | เป็นตัวแยกคำ 
  <chem>Cl2H6N2Pt2+</chem>
  <chem>Al2(SO4)3</chem>

ผลลัพธ์

C₂H₆
Na₂HPO₄ 12H₂O
C₂H₅O₂^-Na⁺
Cl₂H₆N₂Pt²⁺
Al₂(SO₄)₃

วิธีใช้

  <chem>สูตรเคมี</chem>

สามารถเขียนการอ้างอิง journal ใน PubMed ได้ด้วย PMID ดังนี้

การแสดงผลแบบสั้น ให้พิมพ์

  {{pubmed>short:15100837}}

จะแสดงผลดังนี้

การแสดงผลแบบยาว ให้พิมพ์

  {{pubmed>long:15100837}}

จะแสดงผลดังนี้

InterPro เป็นฐานข้อมูล protein families ที่จัดการโดย EMBL-EBI

วิธีการอ้างอิง protein family โดยใช้ InterPro ID ทำได้ดังนี้

  {{interpro>link:IPR001466}}

ผลลัพธ์จะเป็นดังนี้

IPR001466

Jmol เป็นตัวแสดงโครงสร้างเคมีของโปรตีนด้วย Java applet ดังตัวอย่างข้างล่างนี้

วิธีใช้

  <jmol full_path (width) (height) ></jmol>

สามารถเข้าถึง RCSB protein data bank และ NCBI structure database ได้ด้วย PDB ID

แสดงภาพขนาดเล็ก จาก RCSB protein data bank ให้พิมพ์

  {{pdb>small:1WLA}}

จะได้ผลลัพธ์ดังนี้

แสดงภาพขนาดกลาง จาก RCSB protein data bank ให้พิมพ์

  {{pdb>medium:1WLA}}

จะได้ผลลัพธ์ดังนี้

แสดงภาพขนาดใหญ่ จาก RCSB protein data bank ให้พิมพ์

  {{pdb>large:1WLA}}

จะได้ผลลัพธ์ดังนี้

แสดงเฉพาะลิงก์ สำหรับ PDB ID ให้พิมพ์

  {{pdb>link:1WLA}}

จะได้ผลลัพธ์ดังนี้

1WLA

แสดงลิงก์ และคำอธิบายอย่างย่อจาก NCBI structure database ให้พิมพ์

  {{pdb>short:1WLA}}

จะได้ผลลัพธ์ดังนี้

แสดงลิงก์ และคำอธิบายอย่างละเอียดจาก NCBI structure database ให้พิมพ์

  {{pdb>long:1WLA}}

จะได้ผลลัพธ์ดังนี้

แสดง searchbox สำหรับ RCSB PDB ให้พิมพ์

  {{pdb>searchbox}}

จะได้ผลลัพธ์ดังนี้

การแปลงค่าจาก PDB ID ให้เป็น structureID ของ NCBI ให้พิมพ์

  {{pdb>structureID:1WLA}}

จะได้ผลลัพธ์ดังนี้

StructureID:57663

แสดงภาพขนาดเล็ก และคำอธิบายอย่างละเอียด ให้พิมพ์

  {{pdb>fullSmall:1WLA}}

จะได้ผลลัพธ์ดังนี้

สามารถสร้างลิงก์ หรือโครงสร้างเคมี จาก PubChem ได้ด้วย CID (Compound ID)

แสดงเฉพาะลิงก์ ไปยังโครงสร้างเคมี ให้พิมพ์

  {{pubchem>link:6248}}

จะแสดงผลดังนี้

แสดงภาพโครงสร้างเคมี ขนาดเล็ก ให้พิมพ์

  {{pubchem>small:6248}}

จะแสดงผลดังนี้

แสดงภาพโครงสร้างเคมี ขนาดใหญ่ ให้พิมพ์

  {{pubchem>large:6248}}

จะแสดงผลดังนี้

แสดง searchbox ของ PubChem ให้พิมพ์

  {{pubchem>searchbox}}

จะแสดงผลดังนี้

แสดงสูตรเคมีของสารประกอบ ให้พิมพ์

  {{pubchem>formula:6248}}

จะแสดงผลดังนี้

แสดงชื่อ IUPAC ให้พิมพ์

  {{pubchem>IUPAC:6248}}

จะแสดงผลดังนี้

Uniprot เป็น protein database ที่จัดการโดย EMBL-EBI

แสดงลิงก์ด้วยชื่อโปรตีน ให้พิมพ์

  {{uniprot>name:LACTB_HUMAN}}

จะแสดงผลดังนี้

LACTB_HUMAN

แสดงลิงก์ด้วย protein accession ID ให้พิมพ์

  {{uniprot>pac:P83111}}

จะแสดงผลดังนี้

P83111